新鄉醫學院現有臨床醫學、公共衛生、護理、公共管理、藥學、生物與醫藥6個類別專業碩士學位授予權。以下是2020年新鄉醫學院在職研究生專業學位招生專業。

105101       內科學

105102       兒科學

105103       老年醫學

105104       神經病學

105105       精神病與精神衛生學

105106       皮膚病與性病學

105107       影像醫學與核醫學

105108       臨床檢驗診斷學

105109       外科學

105110       婦產科學

105111       眼科學

105112       耳鼻咽喉科學

105113       腫瘤學

105116       麻醉學

105117       急診醫學

105127       全科醫學

105128       臨床病理學